Bios: Origins" é a terceira parte da Trilogia Bios. A ação começa muito antes do que na maioria dos jogos de civilização: há 200.000 anos ou até mais. De um a quatro jogadores representam as subespécies humanas existentes na época: Sapiens, Neandertais, Denisovanos e Hobbits. Embarque em uma aventura para expandir seu cérebro, adquirir linguagem, descobrir novos mundos, domesticar criaturas exóticas (como montar cangurus de guerra ou mamutes), descobrir as maravilhas e terrores da religião, mergulhar por pérolas, desafiar os deuses, escravizar hominídeos rivais e talvez alcançar o Iluminismo. Embora sejam possíveis guerras de conquista e religiosas, a maioria das lutas será interna. Você terá controle limitado sobre sua classe dominante, e se seus sacerdotes estiverem no comando e fizerem um trabalho ruim, serão mortos e usurpados por mercadores ou senhores da guerra.
Ganhe especializando-se como uma civilização cultural, política ou industrial. Isso significa que, ao contrário da maioria dos jogos de civilização, uma figura cultuada no topo de uma montanha na Nova Zelândia pode vencer um imperador que conquistou o mundo com seus exércitos.